Le 9 juin 2008, à 10h22 GMT, les moteurs du module Zvezda sont allumés pendant seize minutes pour les besoins d'un essai dynamique des structures de la station (IWIS, Internal Wireless Instrumentation System).

Le 10 juin 2008, les équipages de la navette et de la station quittent et à 20h24 GMT les écoutilles sont fermées. Discovery se sépare du PMA-2 le 11 juin 2008 à 11h42 GMT et tourne autour de la station pour l'inspecter.

Sergueï VOLKOV, Oleg KONONIENKO et Gregory CHAMITOFF se retrouvent donc seuls à bord de la station. Le prochain événement à leur programme est une sortie dans l'Espace le 10 juillet depuis le module Pirs. En plus des tâches préprogrammées, les cosmonautes devront inspecter le vaisseau Soyouz TMA-12. Les incidents survenus successivement durant les retours sur Terre des deux précédents vaisseaux mènent à croire qu'il y aurait un problème récurrent au niveau de la séparation du compartiment des instruments.

VOLKOV passe une bonne partie de la journée du 17 juin à s'exercer à la préparation d'un scaphandre Orlan-M. Il utilise la combinaison n°25, qui ne sera pas utilisée lors de la sortie, stockée dans le module Pirs et s'entraîne à manipuler les différents systèmes, notamment les batteries et les systèmes de télécommunications.

Le 19 juin, VOLKOV et KONONIENKO assemblent les parties mobiles de leurs scaphandres, en choisissant soigneusement les tailles qui leur conviennent le mieux. Ce même jour, le vaisseau européen Jules Verne est utilisé pour rehausser l'orbite de la station.

Ce sont les moteurs n°1 et n°3 de l'OCS qui sont allumés à 6h41 GMT pendant une durée de   1 205s. La manœuvre apporte un ΔV de 4,02m/s et permet de rehausser l'orbite moyenne de la station de 7,04km. Durant l'opération, c'est le système de contrôle d'attitude russe qui a pris le contrôle de la station. Le système américain a repris le relais peu de temps après.

L'ingénieur de bord Oleg KONONIENKO fête son quarante-quatrième anniversaire le 21 juin. Le 23 juin, aidé par son commandant, il libère de la place dans le module Pirs en vue de la sortie du 10 juillet (le matériel déplacé est stocké dans le module Zaria).

Tout l'équipage revêt les combinaisons Sokol-KV-2 le 24 juin pour vérifier que les couchettes Kazbek-UM sont toujours à leur taille. Ensuite, pendant qu'ils sont dans le Soyouz TMA-12, ils réalisent un exercice d'évacuation, au cas où la sortie ne se passerait pas comme prévu.

Le 25 juin, KONONIENKO et CHAMITOFF installent les lampes frontales américaines sur le casque du scaphandre Orlan-M n°26 (celui de KONONIENKO). Le lendemain, VOLKOV et KONONIENKO enfilent leurs scaphandres et pénètrent dans le vaisseau Soyouz TMA-12, afin de démontrer la faisabilité d'une telle manœuvre.

Les deux cosmonautes russes passent le plus clair de leur journée du 1^er juillet à répéter certaines des opérations qu'ils auront à effectuer lors de la sortie. Ils devront notamment démonter un des boulons pyrotechniques qui assurent la séparation du compartiment des instruments du vaisseau Soyouz. De plus, il est décidé qu'une seconde sortie aura lieu cinq jours plus tard, le 15 juillet.

Dans la nuit du 2 au 3 juillet 2008, les canalisations des réservoirs d'ergols de Progress M-64 sont purgés dans le vide (à 22h50 GMT et 00h30 GMT). Pour cette opération, le contrôle d'attitude est confié au système russe, et les hublots du module Destiny sont fermés.

Le 4 juillet, CHAMITOFF n'a pas le temps de fêter l'Independence Day : il doit s'entraîner dans le Soyouz avec le commandant VOLKOV pour parfaire sa maîtrise des systèmes du vaisseau russe. Pendant la sortie, c'est ici qu'il se trouvera, car comme le Soyouz est amarré à Pirs, il sera coupé du reste de la station, et l'astronaute américain ne pourrait pas évacuer en cas de problème.

Ce même 4 juillet, les moteurs de Soyouz sont mis à feu un bref instant afin de vérifier leur bon fonctionnement. Si l'écoutille du module Pirs ne pouvait pas être refermée après la sortie, l'équipage devrait se réfugier dans le Soyouz, le désamarrer de Pirs et le réamarrer à Zaria. Mais ce module est occupé par le vaisseau Progress M-64, qui devrait donc être détaché. Dans cette éventualité, VOLKOV et KONONIENKO récupère dans le ravitailleur toutes les pièces électroniques qui peuvent être réutilisées. Ils installent ensuite le système d'amarrage StM.

La première sortie de la mission MKS-17 débute le 10 juillet 2008 à 18h48 GMT. VOLKOV (Orlan-M n°27) et KONONIENKO (Orlan-M n°26) sortent par le sas du module Pirs et se dirigent immédiatement vers le mât de charge GStM-1. KONONIENKO s'attache à l'extrémité, tandis que VOLKOV prend les commandes et déploie le bras pour emmener son camarade vers la jonction entre le module de descente et le compartiment des instruments.

Quand KONONIENKO arrive sur place, il commence par prendre des photos. Ensuite, il prépare la principale tâche de la sortie : le démontage de l'un des boulons pyrotechniques de séparation du compartiment des instruments. Le système de séparation est composé de cinq verrous, chacun constitué de deux boulons pyrotechniques.

Avant de se lancer dans le démontage proprement dit, KONONIENKO doit installer une couverture de protection sur les moteurs de contrôle d'attitude de Soyouz (DPO), afin de se protéger en cas de fuite de celui-ci.

Il est ensuite rejoint par Sergueï VOLKOV, et les deux hommes coupent une section de l'isolation thermique, ce qui leur permet d'accéder au boulon qu'ils veulent retirer (sur le verrou n°5).

Il semblerait que c'est celui-ci qui a mal fonctionné sur Soyouz TMA-10 et Soyouz TMA-11, mais si les cosmonautes s'y intéressent aujourd'hui c'est une pure coïncidence : le verrou n°5 est le seul qu'ils peuvent atteindre avec le GStM-1.

Sergueï VOLKOV se charge alors de démonter le boulon explosif, puis il le stocke dans un boîtier. Les cosmonautes remettent l'isolation thermique en place et rangent leurs outils.

Le GStM-1 ramène VOLKOV sur le module Pirs. De là, il prend les commandes du bras pour rapatrier son collègue. Les deux hommes rentrent dans le sas. La sortie se termine le 11 juillet à 01h06 GMT.

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